基本的にはGBA版がベースとなっているが、下記のような違いがある。
-グラフィック全般とインターフェイスが一新。
-キャラクターについてはオリジナルスタッフである渋谷員子による描き起こし。
-BGMはSFC版のものを録音して再生している。
-斜め移動が可能となっている。
代わりにPS版・GBA版にあったダッシュが削除され、SFC版と同じようにダッシューズを装備しないとダッシュができない。
-GBA版にあったサウンドテストモードが最初から使用可能。
-マッシュの「ひっさつわざ」のコマンドがSFC版・PS版・GBA版と大きく異なっている
-カイエンの「ひっさつけん」も選んだ技に応じてチャージする方法に変更されている。
IP:180.22.4.253 TIME:"2015-03-18 (水) 11:51:29" REFERER:"http://h1g.jp/ff6_sp/index.php?cmd=edit&page=%E3%82%B9%E3%83%9E%E3%83%9B%E7%89%88%E3%81%AE%E5%A4%89%E6%9B%B4%E7%82%B9&refer=%E6%90%BA%E5%B8%AF%E7%94%A8TOP" USER_AGENT:"Mozilla/5.0 (Windows NT 6.1; WOW64) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/41.0.2272.89 Safari/537.36"