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*第1話 海賊艦隊提督“首領・クリーク”
|~勝利条件|敵の全滅|~敗北条件|ルフィの敗走&br;または味方全ナワバリの陥落|
**フローチャート
-''&color(#663399){ミッション};'':敵ナワバリを制圧し、毒ガス弾を阻止せよ!
-''&color(#663399){ミッション};'':ゾロと協力し、海賊隊長たちを倒せ!
-''&color(#663399){ミッション};'':サンジと協力し、海賊隊長たちを倒せ!
-''&color(#663399){ミッション};'':敵ナワバリを制圧し、毒ガス弾を阻止せよ!
-''&color(#ff3300){クリーク};''と戦闘。
**クリア後
*第2話 “偉大なる航路”から来た怪物
|~勝利条件|敵の全滅|~敗北条件|ナミの敗走、または制限時間経過&br;または味方全ナワバリの陥落|
**フローチャート
-''&color(#663399){ミッション};'':海兵隊長を倒せ!
-''&color(#663399){ミッション};'':ゾロと協力し、魚人隊長たちを倒せ!
-''&color(#663399){ミッション};'':はっちゃんを倒せ!
-''&color(#663399){ミッション};'':魚人隊長たちを倒し、ルフィを救援せよ!
-''&color(#663399){ミッション};'':海兵隊長を倒せ!
-''&color(#ff3300){アーロン};''と戦闘。
**クリア後
*第3話 名もなき国の冒険
|~勝利条件|敵の全滅|~敗北条件|ルフィの敗走&br;または味方全ナワバリの陥落|
**フローチャート
-''&color(#663399){ミッション};'':敵ナワバリを制圧せよ!
-''&color(#663399){ミッション};'':サンジと協力し、海賊隊長たちを倒せ!
-''&color(#663399){ミッション};'':ラパーンを倒し、雪球攻撃を阻止せよ!
-''&color(#663399){ミッション};'':海賊隊長たちを倒し、チョッパーを救援せよ!
-''&color(#663399){ミッション};'':敵ナワバリを制圧せよ!
-''&color(#ff3300){ワポル};''と戦闘。
**クリア後
*第4話 夢の町“レインベース”
|~勝利条件|敵の全滅|~敗北条件|ルフィの敗走、または制限時間経過&br;または味方全ナワバリの陥落|
**フローチャート
-''&color(#663399){ミッション};'':守備隊長を倒し、砂嵐の攻撃を止めろ!
-''&color(#663399){ミッション};'':ナミと協力し、輸送隊長たちを倒せ!
-''&color(#663399){ミッション};'':Mr.2を倒し、味方ナワバリを守れ!
-''&color(#663399){ミッション};'':海賊隊長たちを倒し、チョッパーを救援せよ!!
-''&color(#663399){ミッション};'':守備隊長を倒し、砂嵐の攻撃を止めろ!
-''&color(#ff3300){クロコダイル};''と戦闘。
**クリア後
*第5話 司法の島の大決戦!!
**フローチャート
-''&color(#663399){ミッション};'':敵増援到着前に、ブルーノを倒せ!
-''&color(#663399){ミッション};'':フランキー子分と協力し、工作兵を倒せ!
-''&color(#663399){ミッション};'':ロビンと協力し、伝令兵たちを倒せ!
-''&color(#663399){ミッション};'':海賊隊長たちを倒し、チョッパーを救援せよ!
-''&color(#663399){ミッション};'':ブルーノ、ジャブラ、カクを倒せ!
-''&color(#ff3300){ルッチ};''と戦闘。
**クリア後
-ウソップが助けてそげキング!を使用可能になる。
*第6話 シャボン舞う諸島の冒険
|~勝利条件|敵の全滅|~敗北条件|ルフィの敗走、または制限時間経過&br;または味方全ナワバリの陥落|
**フローチャート
-''&color(#663399){ミッション};'':海兵隊長たちを倒し、レーザー攻撃を止めろ!
-''&color(#663399){ミッション};'':ブルックとともに、パシフィスタを倒せ!
-''&color(#663399){ミッション};'':戦桃丸とパシフィスタ二人、いずれかを倒せ!
-''&color(#663399){ミッション};'':ロビンと協力し、伝令兵たちを倒せ!
-''&color(#663399){ミッション};'':海兵隊長たちを倒し、レーザー攻撃を止めろ!
-''&color(#ff3300){黄猿};''と戦闘。
**クリア後