本作では、いろいろな場所に過去作のネタが散りばめられています。
- オープニングのアニメでは暴走事件についてのニュースが流れますが、
過去の事件例の中に、あねはづる(P3のモノレール)の暴走もリストに入っています。- 渋谷の駅前広場の柱の広告には、P4の久慈川りせや、P4Dの真下かなみの広告が表示されている。
- 本編中に話が出てくる「伝説の探偵王子」は、P4の白鐘直斗のこと。
- 修学旅行イベント時、ロード中に表示される主人公のアイコンが変化し、
主人公がレイを身に着けたもの(花輪を首にかけている)が表示されます。