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メインゲームでは各ステージにおいて
『分岐』と『勲章』がある
*分岐
メインゲームはコーネリア~ベノムの7ステージ間を進み、
各ステージには特定条件を満たす(失敗する)と次に進むステージが決まる
条件は
・味方の生存 ・ゲートをくぐる
・ボスの撃破 ・敵のレーダーをすべて壊す
・一定数以上敵機撃破 など各ステージごとに異なる。
条件が達成できなかった場合はステージクリア後「任務終了」となり
次ステージへの道は青色で示される
条件を達成するとステージクリア後「任務完了」となり、
赤い道のより高難易度の次ステージが選ぶことができる。
また、ルートの変更で青色で示される道にも行ける
一部、ワープ分岐もあり黄色く示される
*勲章
各ステージには
「一定数以上ヒット数を稼ぎ」かつ「味方3機が無事」
であるとステージクリア後に勲章が貰える
スコアが赤くなると目標値達成だが
その後味方が離脱してしまうと元の色に戻ってしまう
その後味方が離脱してしまうと元の青色に戻ってしまう
一度離脱してしまうと、次ステージも参戦できない(一部例外あり)ため
2ステージは勲章は獲得できない
どうしても勲章を獲得したい場合は1機減らし、ステージをやり直せる
ちなみにこの目標値は、スコアアタックでは銀勲章クラスであり
金を目指すとなると更にスコアを伸ばす必要がある
すべてのステージで勲章を獲得すると
「エクストラモード」が解禁される