オリジナル版との違い

3Dクラシックス版は完全目コピーで調整されており、細かい修正がされているそうです。（修正数は140箇所を超えているらしい）

FC版との違い

• 3D視の都合で画面を広くしている（8ドット）
• ドア(入り口)が分かりやすくなっている。
• 暗転、クラッシュ使用時などの際に、オリジナルでは全体のカラーが変化したが、3DS版ではコックピットをそのままにしている。
• 落下判定がオリジナル版と比べてシビアになった。
• スパークなどの能力にあった処理落ちがなくなった。