世界の終焉を回避するために“方舟”で眠っていた少年ジーンは 方舟の落下という事態に巻き込まれ、地上で目覚める。
自分の見知らぬ姿と化した地上で、 異形の者同士の戦争に巻き込まれ死に瀕したジーンは、 一人の戦士によって“ウォーヘッド”という 新たな存在として生まれ変わる。
だが、それは少年にとって新たな苦難の始まりに 過ぎなかった。
共に方舟で眠っていたはずの姉、アリーズの姿を求め、 無我に戦場を駆け抜けていくうちに、 少年は、いつしか人としての枠組みをはるかに超えた 進化を遂げていく・・・。
