ストーリー

ライトノベル、テレビアニメで大ヒットした『涼宮ハルヒ』がアドベンチャーゲームになって登場！
今度の涼宮ハルヒは「超ゲームプロデューサー」！
「涼宮ハルヒの戸惑」はゲームを制作するアドベンチャーゲーム(？)です。
プレイヤーはキョン(の視点)となってハルヒ・みくる・長門・古泉らおなじみのメンバーと共に、微妙に非日常系学園ストーリーを体験しながら、ハルヒが望むゲームを作り上げていきます。
誰とどんな作業をするのか？
どうすればハルヒが望むゲームが完成するのか？
プレイヤーの行動によって、完成するゲームの内容が変化します。
さらになんと、完成したゲームを遊んでしまうことができます！