このゲームでは、シナリオクリア後などに、進行状況が自動的に上書き保存されます。 また、ワールドマップ画面などで-や+ボタンを長く押し続けたあとに、 「セーブして やめる」を選んでもデータを上書き保存できます。 データは上書きされると保存する前には戻らないので注意してください。
なお、ゲームを再開すると、マリオの残り数は4に戻ります。