ゲームボーイ本体、カートリッジがそれぞれ2つずつあるとVSモードをプレイできます。 VSモードはパズルモードの遊び方と同様となり、 先に自分の教授を到着させるか、相手の教授が天井に押しつぶされると勝ちになります。 2ライン以上ブロックを消すと相手にブロックを送りつけることができます。