火星を本拠地とするサイボーグ軍団「メガノイド」の最高指導者ドン・ザウサーとコロスは、 地球の占領と全人類のメガノイド化をもくろみ侵攻を開始した。 しかし、その野望を打ち砕かんとただ一人立ち向かう男がいた—— その名は、破嵐万丈！ 巨大ロボット「ダイターン3」に乗り込み、今日もメガノイドに立ち向かう。
